06月14 動(dòng)物研究百邁客云解決方案-BMKCloud_數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的豬屬數(shù)據(jù)所涉及研究方向
解決方案概述
針對(duì)動(dòng)物基因組學(xué)研究，百邁客云可通過(guò)BMKCloud_數(shù)據(jù)庫(kù)模塊向用戶提供海量的動(dòng)物高通量測(cè)序公共數(shù)據(jù)，借助公共數(shù)據(jù)，可大幅降低研究成本，提升研究層次。數(shù)據(jù)檢索、下載、保存均在圖形化界面下完成，避免了傳統(tǒng)模式中，須在命令行界面下進(jìn)行數(shù)據(jù)下載、格式轉(zhuǎn)換等一系列繁瑣操作的限制，完全適用于國(guó)內(nèi)生信0基礎(chǔ)的用戶。
對(duì)于公共數(shù)據(jù)的下游分析，百邁客云目前已實(shí)現(xiàn)公共數(shù)據(jù)模塊與分析模塊的無(wú)縫對(duì)接，用戶可直接將已保存至用戶目錄的數(shù)據(jù)直接導(dǎo)入BMKCloud_APP分析模塊進(jìn)行下游分析，該模塊同樣采用圖形化操作界面，無(wú)需用戶掌握任何編程基礎(chǔ)，高度集成化專業(yè)化的分析流程可保證用戶快速完成對(duì)數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)分析以及必要的數(shù)據(jù)深度挖掘。
據(jù).png)
整合mRNA公共測(cè)序數(shù)據(jù)，構(gòu)建豬肉品質(zhì)相關(guān)miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
方案實(shí)現(xiàn)過(guò)程
1）進(jìn)入BMKCloud_數(shù)據(jù)庫(kù)模塊進(jìn)行數(shù)據(jù)檢索與保存。
2）進(jìn)入BMKCloud_APP模塊，簡(jiǎn)單5步完成公共數(shù)據(jù)or自測(cè)數(shù)據(jù)導(dǎo)入及任務(wù)投遞。
3）分析結(jié)果自動(dòng)生成，繼續(xù)使用個(gè)性化分析模快速完成數(shù)據(jù)深度挖掘。
BMKCloud_數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的豬屬數(shù)據(jù)所涉及研究方向：
疾病類研究：豬多系統(tǒng)衰竭綜合征、豬生殖呼吸道綜合征、支氣管哮喘、豬偽狂犬病、豬弓形蟲(chóng)病、全反式維甲酸&抗病、豬圓環(huán)病毒感染、鼠傷寒沙門菌感染、口蹄疫病毒感染、豬巨細(xì)胞病毒感染、脊髓損傷……
生長(zhǎng)發(fā)育類研究：繁殖力、同胎生仔數(shù)、胚胎發(fā)育、豬卵巢發(fā)育、生長(zhǎng)速度、豬肉品質(zhì)、食欲、脂肪組織發(fā)育、肌肉組織發(fā)育、豬背最長(zhǎng)肌分化……
其他：基因組組裝、環(huán)境適應(yīng)、遺傳進(jìn)化……
文章思路
Khan FA et al. ? Analysis of Bos taurus and Sus scrofa X and Y chromosome transcriptome highlights reproductive driver genes. ? Oncotarget. 2017
百邁客云實(shí)現(xiàn)方案
